VASP error - BRMIX very serious problems the old and the new charge density differ 报错解决方案 前言 (Introduction) 在用VASP进行结构优化计算时,稍微复杂一点的体系(电子数较多)有时候碰到这个问题: BRMIX: very serious problems the old and the new charge density differ 这个报错有时候可以忽略,最终也能完成结构优化,但是出现这个报错后往往电子步难以收敛,会跑满默认的步数(NELM = 60),导 2022-01-29 Computational Chemistry VASP DFT
GitHub和Git笔记 本文主要记录一些GitHub和Git的使用笔记。 GitHub Markdown 语法 GitHub基于CommonMark规范拓展了markdown,称为GitHub Flavored Markdown (GFM),目前在GitHub.com和GitHub Enterprise上支持用户内容的格式。包括README文件,issues和wiki均支持GFM语法。 代码diff GFM中 2023-08-15 Notes Git Notes
LaTeX笔记[WIP] 1. LaTeX基础 [WIP] 2. 高效工具 强烈推荐Mathpix Snip这个工具,可以实现公式截图转LaTeX,效果超级好,公式准确无误!唯一的缺点是每个账户只可以免费转10次图片,不过截图的时候可以尽量把公式截在一张图上,然后可以一次性转成LaTeX,并且只算一次转换。 3. 公式杂记 \[ E=mc^2 \] \[ \begin{eqnarray} \n 2023-08-03 Notes Notes LaTeX
python脚本批量进行VASP吸附结构频率计算 前言(Introduction) 在用VASP做催化反应机理分析时,自由能变化是最为重要的分析内容之一。通常需要进行频率计算来进行自由能校正[1]。我们常计算的体系一般是某个(系列)结构吸附一些小的分子或者中间产物,这样的情况下频率计算需要以下几个步骤: 复制CONTCAR为POSCAR 修改POSCAR,fix吸附基底,relax表面吸附的分子 修改INCAR参数 IBRION 2022-03-01 Computational Chemistry VASP DFT python
Windows计划任务+python实现定时久坐提醒,锁屏强制休息 前言 (Introduction) 作为一个不怎么进实验室做实验的高龄PhD candidate,常年坐在电脑前摸鱼看文献写文章一搞就是一整天,长此以往颈椎和腰都要报废了,所以每隔一段时间起来活动下是很有必要的。如果有个工具/软件能每隔1个小时提醒下,起来喝口水(避免肾结石),去室外散步(运动量达标+保护视力[1][2]),休息10分钟,简直就是一举N得。 一通搜索后发现并没有现成的能满足需 2022-02-04 Life tricks python