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VASP error - BRMIX very serious problems the old and the new charge density differ 报错解决方案

前言 (Introduction) 在用VASP进行结构优化计算时,稍微复杂一点的体系(电子数较多)有时候碰到这个问题: BRMIX: very serious problems the old and the new charge density differ 这个报错有时候可以忽略,最终也能完成结构优化,但是出现这个报错后往往电子步难以收敛,会跑满默认的步数(NELM = 60),导
2022-01-29
Computational Chemistry
#VASP #DFT

2025月度总结

2025-01 读书 高频交易员 运动 影视 鱿鱼游戏 第二季 ★★★★☆ 绝命毒师 第二季 ★★★★☆ 学习工作 下月计划
2025-01-01
Review
#monthly review

VASP中各种能量energy的含义简析

MD计算中各类能量相关物理量解析 当用VASP做MD计算后,得到的输出文件slurm-xxxxx.out中有大量关于能量的物理量,根据官方教程,做下笔记。 一个典型的输出大概大概长这样: 12345678910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152 running
2024-08-15
Computational Chemistry
#VASP #DFT

2023月度总结

2023-01 读书 暂无 运动 由于年末阳了,这个月基本没有运动 影视 弥留之国的爱丽丝 第一季 ★★★☆☆ 预期比较高,但是看完之后有点无感。游戏套路感比较强。 弥留之国的爱丽丝 第二季 ★★★★☆ 有了第一季的预期之后,反而感觉第二季还不错,特别是最后的结尾处理得很好的感觉。 捕蝇纸 ★★★☆☆ 有点无脑,下饭的黑色幽默喜剧 学习工作 第二篇论文主
2023-12-31
Review
#monthly review

GitHub和Git笔记

本文主要记录一些GitHub和Git的使用笔记。 GitHub Markdown 语法 GitHub基于CommonMark规范拓展了markdown,称为GitHub Flavored Markdown (GFM),目前在GitHub.com和GitHub Enterprise上支持用户内容的格式。包括README文件,issues和wiki均支持GFM语法。 代码diff GFM中
2023-08-15
Notes
#Notes #Git

LaTeX笔记[WIP]

1. LaTeX基础 [WIP] 2. 高效工具 强烈推荐Mathpix Snip这个工具,可以实现公式截图转LaTeX,效果超级好,公式准确无误!唯一的缺点是每个账户只可以免费转10次图片,不过截图的时候可以尽量把公式截在一张图上,然后可以一次性转成LaTeX,并且只算一次转换。 3. 公式杂记 \[ E=mc^2 \] \[ \begin{eqnarray} \n
2023-08-03
Notes
#LaTeX #Notes

2022月度总结

2022-01 读书 《置身事内:中国政府与经济发展》 进度:50% 《刻意练习:如何从新手到大师》 这个月读书时间短,可以忽略不计了.... 影视 《琅琊榜》 《开端》 《遗愿清单》 《死亡诗社》 《不要抬头 (Don't look up)》 《名侦探柯南:绯红的子弹》 补完了之前想看的《琅琊榜》,又追了《开端》,柯南的剧场版属实是一言难尽。 运动
2022-12-31
Review
#monthly review

对称加密和非对称加密 加密过程和解密过程使用的同一个密钥称作对称加密。由于加密和解密是一对可逆操作,简单高效,开销较小,广泛用于各种加密协议的核心中。常见的加密算法有AES、DES等。对称加密的最大缺点之一就是密钥的管理和分配。由于加密和解密都使用同一密钥,所以密钥不可避免地需要在网络中传播,被 https://www.ruanyifeng.com/blog/2011/08/what_is_a
2022-05-28
Life tricks
#GPG #privacy

python脚本批量进行VASP吸附结构频率计算

前言(Introduction) 在用VASP做催化反应机理分析时,自由能变化是最为重要的分析内容之一。通常需要进行频率计算来进行自由能校正[1]。我们常计算的体系一般是某个(系列)结构吸附一些小的分子或者中间产物,这样的情况下频率计算需要以下几个步骤: 复制CONTCAR为POSCAR 修改POSCAR,fix吸附基底,relax表面吸附的分子 修改INCAR参数 IBRION
2022-03-01
Computational Chemistry
#VASP #DFT #python

Windows计划任务+python实现定时久坐提醒,锁屏强制休息

前言 (Introduction) 作为一个不怎么进实验室做实验的高龄PhD candidate,常年坐在电脑前摸鱼看文献写文章一搞就是一整天,长此以往颈椎和腰都要报废了,所以每隔一段时间起来活动下是很有必要的。如果有个工具/软件能每隔1个小时提醒下,起来喝口水(避免肾结石),去室外散步(运动量达标+保护视力[1][2]),休息10分钟,简直就是一举N得。 一通搜索后发现并没有现成的能满足需
2022-02-04
Life tricks
#python

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